Desarrollada por el general Tolkki, la IA central se encarga de llevar a cabo todo tipo de procesos esenciales para el correcto funcionamiento de Nexus. Gracias a ella poseemos datos de las sondas de largo alcance, calculamos rutas viables hacia los diferentes OEM o establecemos comunicaciones con la estación Brem. El control de todas las IA de a bordo pasa por este sistema, que es controlado por tecnólogos y personal especializado de la máxima confianza del Dominio, ya que tradicionalmente ha sido uno de los principales objetivos del sabotaje de los Rebeldes; el modelo cuenta con un sinfín de drones defensivos, así como un entorno totalmente controlado que permite sumergir y sellar el módulo central en caso de ataque. En la IA central se encuentran información clasificada sobre los planes de la autoridad de Nexus: proyectos secretos, memorias de OEM y, según dicen algunos, datos sobre contactos con una especie alienígena excepcionalmente peligrosa conocida como acechantes, aunque el Dominio no reconoce abiertamente su existencia ni los diversos ataques a pelotones que se les atribuyen. Se cree que aquí se almacenan también datos de personal infiltrado entre las filas de los Rebeldes, algunos de los cuales se hacen pasar por fantasmas con el beneplácito del gobierno para espiar a la facción enemiga.
En los últimos tiempos la instalación de ciertas mejoras en la IA central ha evitado que su integridad quedase comprometida en caso de ataque; así, existe toda una serie de sistemas auxiliares subterráneos que dan soporte al módulo principal. Dichos sistemas han ido asumiendo diferentes labores para reducir la dependencia de la IA central, aunque el proceso es lento y laborioso. Algunos ingenieros hablan de que la IA central ha cobrado tal capacidad de toma de decisiones que es posible que ella misma esté alterando la programación para evitar que se le resten poderes sobre la nave Nexus que le ha sido confiada. Unos dicen que esto es debido a la increíble capacidad de aprendizaje que posee el sistema gracias al diseño inicial del general Tolkki, mientras otros sospechan que tal vez se trata de una manipulación de los Rebeldes. El Dominio afirma que la IA central está bajo control, y sin duda con eso es con lo que debemos quedarnos.
Basado en un informe de Arturo VWolfplayer. El Dominio agradece su valiosa aportación al Sistema Atenea.